首先肥猫最不能理解的是：

跑去外面的地藏菩萨取钥匙，再折回来打开寄存柜。

然后，把钱一捆一捆地放在眼前看。
肥猫最不能理解的是：这些举动看样子都特别费时间，而且时间长度不好精确把控！！！
肥猫之前猜测凶手按照时刻表设置了自动发送短信的功能，轻易的实现了众目睽睽之下还能够指挥一群人东奔西跑。然而，由于这些费时间的举动，导致“自动发送短信”诡计的成功率下降。
这时有两种可能：
1、凶手真的和金田一一样，在一旁围观这6人，并从容的发短信指挥。这个方法最无脑，但会导致凶手不是有名有姓的人，而且凶手和金田一都必须跟着6人一路狂奔，有可能被发现。
2、凶手在这6人之中，通过特殊的手段在众目睽睽之下指挥其余5人。肥猫讨论一下这个方法。

首先，凶手给所有人准备了手机，而且还是印了名字一一对应的。如果凶手是6人之一，他就可以从容的拿起自己的手机。别人的都只能收短信，但凶手的手机可能可以发短信。

这个“时刻注意手机屏幕”是个心理暗示，这样凶手就有名正言顺的操纵手机的理由了。
但是，如果凶手在6个人之中，那么肯定知道JC会暗暗地跟踪，如果不采取一些措施，被JC看到他发短信就不好了。

所以，凶手才做出一个看似奇怪的指示：“一个一个把钱放在眼前，看看有没有追踪装置”。
山南（便当脸）对这个指示的推断是：凶手躲在某个地方看着我们。
肥猫的推断是：这个举动是做给JC看的，使JC有充分的时间确认钱在土方那里。

然后，凶手冒险做出最后的指示，即让大家分散，其中拿钱的土方在第6车厢。越靠近土方，JC的数目越多，越远离土方，JC数目越少。凶手就可以更安全的发送短信指挥其余5个人了。
因此，处于第1车厢的永仓新八（脸盲，靠头带区分人）嫌疑MAX。

特别是这幅图最后的那个指示：把装了钱的包跟土方副长的包交换。
肥猫总觉得很别扭。如果是各人的包的确有不同，凶手需要把钱装到土方的包里面，那么为啥不直接把钱装土方的包里面。而是多此一举，先装到近藤的包里面，再换给土方。
肥猫猜不出这里面有什么魔术手法，所以只能认为凶手是做给JC看的。
CASE A：如果直接把钱装入黑包，然后进站，那么从JC的视野，看到的是：钱在一个黑包里面，但6个人同时拿起包就走，看不清究竟谁最后拿了装钱的包。
CASE B：先装到一个黑包，再递给土方，那么JC就能很清楚的看到土方接了一个包（大概率有钱），从而知道一会跟踪带钱的土方。

经过 @Dani1982 大大的提醒，发现嫌疑最大的永仓新八，就是一开始阻止其余5人叫JC的那个人

肥猫继续观察永仓新八，发现他是第一个主动请缨帮忙的。
心理学应该有类似的解释，譬如：
A、大家一开始都围观，只要有一个人出手相助，其他人也会去帮忙
B、捐款箱里面没有钱，路人就不会捐款，自己先放点钱进去，路人就会捐款（亲身经历）
C、自行车篮子里有了一个垃圾没清理，第二天就堆满了垃圾（痛苦经历）

这一个取钥匙的桥段肥猫也觉得不爽，钥匙藏哪里不好，非要藏得这么远。
肥猫根据金田一说的“又回来了”，推测凶手通过这种折返的形式，来看看谁在尾随6人组。毕竟跟踪的人最怕被迎面碰上。

当然，还有其他的伏笔不知道有什么用

首先是黑包的顺序，估计是有些黑包有机关吧。毒针？把钱掉包？
大家觉得，凶手的目的是啥？
A、杀人
B、拿钱
C、杀人+拿钱（太贪心了）

二三被囚禁在什么地方？
不过凶手似乎不在身边，看来二三脱困得靠自己了。

奇怪的说话语气：
竟然用了一堆客气的话（辛苦了，请，近藤局长）

一开始给剑持打电话时，语气轻佻（嘿，刑警先生，我拐了一个小学女生哦？）

说话不带商量，命令语气很强。

短信也是命令语气，没有商量的余地。

给6人组的短信也是命令语气。
所以肥猫很奇怪，感觉写信的人和其它的不是一个人。。。但逻辑说不通，目前观望中。。。

经过和 @爱克莱尔的里昂 大大的讨论，结合上一次肥猫发现的奇怪路线，似乎存在一种杀人手段。

首先一节地铁是很长的，一般人最多观察自己车厢的人，如果离旁边车厢近也可以顺道观察旁边车厢。譬如金田一只能看到土方和隔壁车厢的美雪。
加上换站的时间非常紧迫，大家都是跑步前进，如果中途有人脱团，别人是没法发现的。
所以凶手只需要提前很长时间给4个无辜的人发送换乘指示，而在开门时才给罪人发送换乘指示，那么就会造成罪人赶不上换乘车而脱团。当然，凶手也趁机脱团，慢悠悠的杀掉罪人。

但是脱团的凶手如何再与其余4人会合呢？就是通过上图的诡异路线，即凶手指示4人组绕了一个远路(青山一丁目->大门->森下)，而凶手走近路(青山一丁目->九段下->森下)，可以节省10分钟（用于杀人和处理尸体），然后再从容的在森下站与大家会合。

之前在和 @混沌之女神 大大 讨论新八阻止联系JC的嫌疑。一开始还是接受混沌大大的观点（新八嫌疑不大），因为：
1，新八是被近藤勇点名回答的，不是主动回答
2，新八的回答没有原则性问题。

后来肥猫再仔细看了看凶手的指示。
凶手只是“不许JC之类的跟踪”，而没有不许“联系JC”。
所以肥猫还是觉得新八的回答有些问题。
另外，近藤勇询问其他人是否联系JC，也说明这个问题的答案不是唯一的。
@星之風双鱼 @爱克莱尔的里昂 @Dani1982 @樱花丽子